Le Professeur Philippe Compagnon a effectué ses études de médecine à l’Université Claude Bernard de Lyon (France), avant de réaliser son internat de chirurgie aux Hôpitaux Universitaires de Strasbourg (France), où il obtient son doctorat en médecine (MD) en 1997.
Entre 2002 et 2006, il effectue son clinicat au Centre Hospitalier Universitaire de Rennes (France), où il a acquis une solide expérience en chirurgie hépato-biliaire et en transplantation. Après un «research fellowship» de 2 ans dans le laboratoire de conservation d’organes de l’Université du Wisconsin (Madison, USA), il a obtenu son doctorat en biologie et sciences de la santé (PhD). Il a ensuite assuré la fonction de médecin adjoint au Centre Hospitalier Universitaire de Rennes (France) pendant 6 ans, avant de rejoindre en 2012 l’assistance publique - hôpitaux de Paris (APHP, Centre Hospitalier Universitaire Henri Mondor, France) où il fut nommé Maitre de Conférences - Praticien Hospitalier (MCU-PH). Il y fut promu Professeur des Universités en 2015.
Son activité clinique est partagée entre la transplantation hépatique et la chirurgie hépato-biliaire. Sur le plan académique, son activité s’articule autour de l’enseignement et la recherche, à la fois clinique et expérimentale, se focalisant sur les moyens réduire les lésions d’ischémie-perfusion en transplantation hépatique. Dans cette optique, il travaille sur le développement d’une nouvelle machine de perfusion hypothermique du greffon hépatique.
Arrivé aux Hôpitaux Universitaires de Genève en décembre 2017 comme Professeur invité, il fut nommé Professeur Associé au Département de Chirurgie - Service de Transplantation en décembre 2019. Il devient ensuite médecin chef du Service de transplantation en octobre 2022.