Frédéric Triponez a fait ses études de médecine et sa formation de base en chirurgie à Genève.
Il complète sa formation en chirurgie endocrinienne (thyroïdes, parathyroïdes et surrénales) à Lille puis à San Francisco.
De retour à Genève en 2005, il développe cette activité pour créer le plus grand centre suisse de chirurgie endocrinienne.
Il complète parallèlement sa formation en chirurgie thoracique à Paris.
Depuis 2013, il est le médecin-chef du service de chirurgie thoracique et endocrinienne des HUG ainsi que professeur ordinaire à la Faculté de Médecine.
Il est nommé chef du département de chirurgie le 1er octobre 2018.